​病毒性嗜血细胞综合症绝大多数病人都能治好。
噬血细胞综合症发病较急，症状比较严重，多数病人往往持续高烧不退，肝脾、淋巴节肿大，全血细胞减少，骨髓穿刺、活检和淋巴结活检可以看到噬血现象。经过环孢素、丙种球蛋白以及联合化疗治疗后，多数病人都能够治愈。
极少部分合并淋巴瘤，或者是先天性遗传性的基因缺陷所导致的难治复发性嗜血细胞综合症病人，经过JAK-2受体阻断剂治疗，临床症状控制后尽快进行异基因造血干细胞移植手术，仍有治愈希望。移植后复发病人预后较差。