尿呈咖啡色，需要结合尿液常规化验以及泌尿道彩超、膀胱镜等检查，明确疾病诱因后，针对性治疗。
尿液颜色变化提示可能是泌尿道出血、尿路感染、肿瘤等病变。相关疾病导致尿比重，以及尿液成分改变导致尿液颜色异常，明确泌尿道结石导致的尿液咖啡色改变，可考虑选择无创体外震波碎石方式处理。
由于泌尿道患有肿瘤性病变，肿瘤细胞侵犯血管黏膜，导致的尿液咖啡色改变，限期安排手术切除肿瘤。急性泌尿道感染导致的尿液咖啡色变化，可口服或静脉点滴喹诺酮类抗生素治疗。