脑干肿瘤可为良性也可为恶性，脑干肿瘤的分期通常是对于恶性肿瘤而言的。
脑干的肿瘤与身体其它部位的肿瘤一样，通常也是采用TNM分期系统，但是由于脑部肿瘤很少会发生淋巴结的转移，所以脑干肿瘤一般采用TM分期，即T代表原发肿瘤的大小，M代表有无远处器官的转移。
脑干肿瘤临床上通常表现为脑神经受损的相关症状，例如头痛、头晕等，压迫视神经会导致眼球的内斜或复视，压迫面神经导致面部感觉障碍及面瘫等。脑干肿瘤的患者，晚期还会出现颅内压增高的表现，例如头痛、恶心、呕吐等。