打喷嚏出来的口水很臭的原因比较多，既见于生理性因素，也有可能是病理性因素所致。其中生理因素主要是由于平时口腔清洁不到位，饭后没有及时漱口，牙缝当中可能会长时间储存食物残渣。食物残渣一旦经过发酵便容易形成挥发性硫化物、氨气等，所以打喷嚏时也会出现口水很臭的情况。
如果患有咽炎、鼻炎、鼻窦炎、扁桃体炎，由于局部会产生脓性分泌物，一旦流至咽部，也会与唾液相结合，进而出现打喷嚏口水有臭味的现象。
除此之外，牙周疾病、龋齿等，也会由于局部化脓、溃疡或者炎症引发此种症状，应根据不同情况予以治疗。