小儿脑脓肿主要的原因可能是病原微生物的感染，比如细菌、真菌以及寄生虫的感染，而且引起脑脓肿最常见的细菌是链球菌、葡萄球菌以及厌氧菌。部分患者还可能会并发其它病原微生物的感染。
主要的感染途径有血行传播或者临近感染组织扩散。在选择用药上，首先是要明确疾病的病因，并且根据疾病病因选用药物治疗。
如果脓肿较大，有可能需要穿刺引流，因此具体情况具体分析。如果不积极的治疗，有可能会导致患者出现意识障碍以及对侧偏瘫，或者感觉障碍。