炎症性肠病关节炎就目前来讲，是不能自愈的疾病。
如果治疗不及时，治疗不得当，病情就会逐步发展，慢性迁延，出现严重的并发症和严重的后果，甚至会危及生命。所以，一定要在早期就开始正确的治疗，还要坚持随诊。
一般来讲，可以应用镇痛、消肿的药物，缓解关节炎的症状，还要联合改善病情药物，延缓疾病的发展，减少复发。比如柳氮磺吡啶，或者应用甲氨蝶呤、硫唑嘌呤等。必要时，也可能应用糖皮质激素，或者生物制剂等进行治疗。一旦出现严重的并发症，还可能需要外科手术治疗。