1.肾盂肾炎：表现为一侧腰痛、伴有脓尿、体温升高，甚至达到40度以上。而肾结石也可以表现为腰腹部疼痛、泌尿系统感染等，一般没有脓尿，体温可以正常或者稍微偏高。
2.肾癌：患者最典型的症状是血尿，如果肿瘤增大，腰部或腹部可扪及一个包块，而肾结石不能扪到包块。
3.急性胆囊炎：这属于肝胆外科的疾病，患者表现为右上腹疼痛，饭后加重，可以伴有恶心、呕吐、畏寒、发热、食欲不振、返酸等消化道的症状。而肾结石的病人一般不伴随消化道的症状，建议去正规医院的泌尿外科就诊。