黏膜白色海绵状痣需要进行体格检查以及相关实验室检查，可以观察黏膜是否有海绵状皱褶，柔软是否可以刮去，刮去时是否有疼痛感，是否出血、有黏膜部位烧灼麻木、味觉减退等症状。
进行组织病理学检查，通过观察组织上皮增厚的病理特点作出诊断。也可提取病变组织，通过观察组织超微结构，如胶原蛋白形成异常作出诊断，明确诊断后及时治疗。
黏膜白色海绵状痣是一种良性疾病通常不会恶变，可以选择药物治疗为主，必要时进行物理治疗或手术治疗。可以选择局部涂抹全反式维a酸，杀菌作用的氯己定、伊沙吖啶。必要时可加用抗感染作用的药物，比如四环素、青霉素、制菌霉素、阿奇霉素。充血水肿、炎性反应严重者可加用抗组胺药，如氯雷他汀。对于小范围的能够用液氮冷冻或激光治疗。对于病变局限可以完整切除的，可经手术切除治疗。