变应性鼻炎可以引起头痛。变应性鼻炎发作时鼻黏膜充血、肿胀刺激鼻腔黏膜的神经末梢，引起反射性鼻腔疼痛、头痛等。变应性鼻炎鼻黏膜肿胀会造成鼻腔狭窄、通气功能下降，患者鼻塞明显，引起头部缺氧也可以引起头痛，必要时给予止痛药减轻症状。
变应性鼻炎合并鼻窦炎也可以引起头痛，急性发作者一般都伴有细菌感染，应当及时给予抗感染对症治疗。除了使用抗生素治疗以外，还可以使用血管收缩剂外用鼻喷激素，快速消除鼻腔黏膜水肿，减轻充血，改善患者鼻腔的通气状态缓解鼻塞。若鼻腔内分泌物较多伴有脓鼻涕，可以口服粘液促排剂促进脓液的排出。
一般通过上述药物治疗，患者的症状可以得到迅速的缓解。若患者有反复发作的病史，药物治疗效果差者可以考虑手术治疗。治疗期间患者要多饮水、清淡饮食、合理休息、避免熬夜。