胎儿心脏肿瘤跟染色体可能有一定的关系。胎儿原发性心脏肿瘤的具体发病原因不详，有些患者可能存在染色体的缺陷。有些患者的染色体缺陷可能来自遗传，父亲或母亲的染色体存在病理性的变化，通过遗传的方式传递给胎儿。有些患儿可能是在胚胎发育的过程中出现了染色体的变异导致患者发生心脏肿瘤。
肿瘤的发生发展是一个非常复杂的过程，具体的发病机制目前仍不清楚，在肿瘤发展的过程中，基因的突变或异常可能就是一个主要的原因。
所以，发生胎儿心脏肿瘤的患者可以进行染色体的检测，能够明确是否存在染色体的异常。