疫咳的主要检查包括实验室检查和X线检查。实验室检查有：
1.血常规检查。疫咳患者的外周血白细胞和淋巴细胞数值升高，这两个数值的升高与疫咳的严重程度相关。
2.血清检查。这主要是用于流行病学的研究。
3.病原学检查。可以用PCR技术检测患者鼻咽分泌物中的百日咳杆菌的DNA，这项诊断具有快速、敏感、特异性强的优势。也可以通过细菌培养直接培养鼻咽分泌物，检测百日咳杆菌。X线检查中，没有并发症的疫咳患者胸片检查一般正常，部分患者存在轻微异常。