连续三天发烧的原因很多，可能是病毒或细菌感染，也可以是非感染性疾病等引起。由于病毒或细菌感染使机体引起炎症反应，并且产生致热原，刺激体温调节中枢引起发烧症状。如果不能有效控制感染，就容易出现连续三天发烧不退或发烧持续时间更长。
另外，非感染性因素，如恶性肿瘤、严重贫血、结缔组织病，如红斑狼疮等，也可以出现连续三天发烧。
因此，如果出现连续三天发烧不退，需要结合病史及相关检查，查清原因针对性用药，还可同时使用解热镇痛药物治疗。