小儿肾小管损伤处理措施如下：
1.要明确引起肾小管损伤的病因，还要明确肾小管损伤的类型是急性还是慢性。
2.如果是急性肾小管损伤一定要消除致病的因素，比如针对感染需要使用抗生素控制感染，针对肾毒性药物要停止使用该药物，对于缺水、低血容量要及时补充液体。如果病情达到尿毒症标准需要透析治疗，同时要补充充足的热量。
3.如果是慢性肾小管损伤，平常不要使用对肾脏有损伤的药物，针对水肿、高血压可以使用利尿、降压药物，适当使用虫草制剂可以减轻肾小管的损害。