鼻部穿通性毛囊炎的发病机制主要与皮肤化脓性球菌感染有关系，同时与免疫力低下、卫生条件差、糖尿病局部搔抓引起皮肤屏障功能破坏有关系。
化脓性细菌从鼻腔内皮浸入，鼻毛根部毛囊口周围小脓疱后，毛囊炎向深部浸润，穿破皮肤，而在鼻翼上产生小脓疱，脓疱内包含有受感染的鼻毛。整个过程就是化脓性细菌感染，从内侧穿透鼻翼，穿向外表形成窦道。
所以日常生活中，要治疗相关的免疫力低下的疾病，同时要改变不良的卫生习惯。不要用手指挖鼻孔，以免皮肤黏膜受损，引起局部细菌感染。