念珠菌性甲沟炎和普通的甲沟炎的区别，在于感染的细菌种类不同。
念珠菌性甲沟炎主要是在日常生活中，手部或脚部因感染了念珠菌，而形成了甲钩的一些炎症。这种情况主要是由于指甲对周围组织形成刺激时导致破损，然后感染到手部的念珠菌，顺势进入皮损部位而引发的一些改变。
而甲沟炎则一般感染的是细菌，这种情况可能是金黄色葡萄球菌，也可能是表皮葡萄球菌，是指甲对局部组织形成刺激，导致破损之后，因接触了某些脏东西，而导致的一些炎症反应。会在局部组织形成明显的红肿疼痛，并且伴随着按压性的疼痛加剧。