肛瘘主要表现是从肛门周围皮肤上的创口反复的淋漓不断的向外流脓或流血，甚至流出粪便，因而将此称作漏。有没有肛瘘可通过以下症状来判断。
一、看局部有没有流脓，急性炎症期流脓多且常有臭味，慢性炎症期流脓少，时有时无，脓汁稀淡或成米泔样分泌物。
二、由于分泌物刺激，肛门部瘙痒，潮湿不适，有时形成湿疹。一般无疼痛，如引流不畅，分泌物堵塞或反复发炎症者可引起疼痛。肛缘硬索状物常为病人的主诉之一，炎症急性发作时，若外口封闭，引流不畅时肿块增大。急性期有发热，长期化脓的复杂性肛瘘，可伴有贫血、消瘦、食欲不振等全身症状。