支原体、衣原体感染的治疗时间需要1~2周的时间，所以只要时间在7~14天左右，而有的患者还会延长治疗的时间，特别是抵抗力比较弱，或者感染程度比较重，需要延长到4周左右。
所以针对支原体、衣原体感染的患者，应该先确定感染程度、感染部位以及患者的抵抗力，还要注意支原体、衣原体对于治疗药物的敏感性。
在必要的情况下，也应该进行药物的敏感试验，来使用更加敏感的治疗药物，起到最佳的治疗效果。还要给患者定期进行支原体、衣原体抗体的检查，以及提高患者的抵抗力，饮食要有规律，充分休息。