下颈椎不稳症容易与以下两方面的疾病相混淆：
第一，如果是下颈椎不稳症压迫了椎动脉，导致脑部的供血不足而出现有头晕的症状，则容易与脑部的血管病变相混淆，例如是后循环缺血、脑动脉硬化，或者是脑梗死等情况。
第二，如果是下颈椎不稳症压迫了上肢的神经根而出现有肩背部，以及上肢的神经牵拉性疼痛、麻木、乏力等症状，则容易与颈椎的小关节错位、颈椎的椎间盘突出相混淆。这种情况可以通过查颈椎的X光片或者是颈椎的CT，甚至核磁共振来诊断与鉴别诊断。