腘窝积液和腘窝囊肿是有区别：
第一，发病原因不同，腘窝积液常是由于腘窝周围的慢性无菌性的炎症，或者是由于周围软组织的感染，以及外伤的积血而导致腘窝处的积液。而腘窝囊肿常是由于外伤之后，导致膝关节后方腘窝周围的肌腱囊性的病变，或者是关节囊囊性的病变。
第二，是临床表现不同，腘窝囊肿在早期可以没有症状，而囊肿比较大时，可以出现局部的疼痛，可以影响关节的活动。而腘窝积液常可以有局部的疼痛，严重者会有红肿，影响关节的活动。
第三，是治疗方法不同，腘窝囊肿如果囊肿比较小，没有症状是不需要手术的。只有当囊肿比较大时，影响了关节的活动，严重的疼痛时可以手术，而腘窝积液常需要手术切开引流来治疗。