舌头上起水疱的治疗需要先明确其诱发原因，对因治疗才能有效，临床上舌头上起水疱常见以下两种情况：
1.就是发生在舌头上的黏液腺囊肿，多位于舌腹部尤其是靠近舌尖处，这种情况需要手术切除治疗，黏液腺囊肿的复发率比较高，多是创伤性因素导致，所以在平时吃饭的时候注意要细嚼慢咽，避免狼吞虎咽，也避免吃过硬的食物。
2.情况就是疱疹性的口腔溃疡，这种情况也可以表现在舌头上有成簇的小水疱，对于这种情况需要在医生指导下应用抗病毒药物治疗。