咽旁脓肿的并发症是：可并发咽后隙及腮腺隙等周围组织感染。颈动脉鞘感染为咽旁隙感染最常见、最严重的并发症。炎症侵及颈动脉壁可发生致死性大出血。颈内静脉受累，可引起血栓性静脉炎及脓毒性败血症，危及生命。
病变早期以消炎治疗为主，为防止炎症扩散及并发症的发生，可应用足量的抗生素及磺胺药治疗，局部热敷或理疗。
患者最好卧床休息，多饮水，多食用容易消化吸收的流质食物，必要时可给予镇静剂及缓泻剂。脓肿形成期必须积极手术治疗，经颈外径路切开排脓。