再生障碍性贫血的患者是需要进行骨髓穿刺检查的。通常情况下骨髓穿刺检查可以对再生障碍性贫血做出重要的提示性的诊断。病人骨髓穿刺涂片当中有可能会出现少量的油滴，增生往往是减低的，有的时候甚至有可能会出现重度的减低。
再生障碍性贫血的患者骨髓当中粒系、红系以及巨核细胞都可以出现减少，淋巴细胞比例通常会出现增多，有的时候还可以见到非造血细胞团。再生障碍性贫血的患者必要时还需要进行骨髓活检的检查，造血组织呈现均匀性的减少，有助于再生障碍性贫血的诊断。
之所以再生障碍性贫血患者进行骨髓穿刺检查有担心，往往是因为血小板比较少，病人担心出血，其实只要是适当的多按压一会，多数的再生障碍性贫血的患者进行骨髓穿刺检查，是不会引起严重出血的。