一般情况下，新生儿脐肉芽肿不会自己掉下来。
但如果脐部肉芽肿比较小，通过日常的清洁、消毒，可能会出现自愈的情况。在此过程中，尽量不要把脐部弄湿，保持其清洁、干燥，平时要让患儿穿纯棉的衣物，减少对脐部的刺激，有利于恢复。也可以用缝线结扎，主要是为了将肉芽肿的血运切断，使其缺血坏死，在2~3天后可以脱落。
如果小儿的脐肉芽肿体积比较大，此时可通过在医生的指导下进行手术切除，手术后肉芽肿会脱落。在术后也要注意护理，避免脐部感染，造成严重后果。