对于肉毒中毒的患者，轻症者不会有低热伴随心慌，但是严重的中毒通常都会有低热，伴随头晕、眼睛疼痛、心慌、心悸的临床症状。通常肉毒中毒的时候，患者一般都会有头晕、头痛、周身乏力。
对于神经系统刺激症状相对比较明显，患者会表现为眼睛疼痛、视物模糊、视物不清、双眼的辐辏功能不佳、眼球活动功能障碍，甚至有的患者出现眼睑下垂、瞳孔散大、对光反射消失，这些症状都会伴随着眼睛疼痛。
另外，还有些患者有心律失常的症状，表现出心慌、心悸、胸闷、气短。还有一些患者因为肉毒中毒合并有细菌感染或病毒感染，出现发低热、腹痛、腹泻等临床表现。