呼吸衰竭肺部感染的治疗，首先是氧疗、纠正缺氧状态，对于单纯低氧血症不伴有二氧化碳潴留的呼吸衰竭，可以给予高流量氧疗，伴有二氧化碳潴留者应该给予低流量氧疗。
如果不能改善者可以使用机械通气治疗，对于肺部感染如果是细菌感染，应该根据感染的类型，经验性选择抗菌药物，留取病原学标本行培养及药敏检查，根据药敏结果使用有效抗菌药物。
对于真菌感染者需行抗真菌治疗，病毒感染者需要施行抗病毒治疗。另外辅以化痰、解痉、维持内环境稳定、营养支持等治疗。