自然流产后出现腰疼，有可能是出现了不全流产，胚物残留或者继发感染等情况。自然流产后有可能出现不全流产，有可能残余部分妊娠物在宫腔内，影响子宫收缩，导致阴道出血量多，出血时间长，有的还会并发感染。
流产时都会导致宫颈口的扩张，流产以后会出现阴道少量的出血，通常会持续3～5天，甚至1周。如果在流产后短时间内进行性生活或者盆浴、游泳等，容易发生逆行感染，导致阴道炎症、宫腔炎症、盆腔炎症，甚至盆腔脓肿等。所以有可能出现腰疼、阴道持续出血、有异味等症状。
如果出现流产后不适的症状，尽快到医院复查身体恢复情况。