睾丸囊肿术后多久恢复并不能一概而论，每个患者自身身体素质不同、病情程度不同，恢复时间也是不同的。多数患者术后两周左右可基本恢复。
如果睾丸囊肿手术后长时间没有恢复，应到医院进行复查，明确病情恢复的程度，查找引发恢复慢的原因，对症进行处理，尽快恢复。睾丸囊肿分离手术可能会造成后遗症，如果消毒不彻底，可能会造成感染，如果手术操作不当，可能会出现睾丸损伤、萎缩变小、影响睾丸的正常功能。
但近年来医疗技术水平不断进步，这些后遗症是比较少见的，患者不必过于紧张。术后患者应多休息，定期换药，注意伤口部位的清洁，避免引发感染。