生殖器疱疹是单纯疱疹病毒(HSV)引起的性传播疾病，单纯疱疹病毒I型、Ⅱ型均可致人类感染。I型称口型或上半身型，占10%，主要引起上半身皮肤、粘膜或器官疱疹，如唇疱疹、疱疹性脑炎等，但极少感染胎儿，尽管也有报道从外阴疱疹中分离出I型病毒，仍属少见。Ⅱ型称生殖器型，占90%，主要引起生殖器(阴唇、阴蒂、宫颈等)、肛门及腰以下的皮肤疱疹，直接由性接触传播占绝大多数，以青年女性居多。孕妇患单纯疱疹病毒Ⅱ型感染，可以垂直传播给胎儿
主要与硬下疳，软下疳鉴别：
硬下疳为单个质硬的溃疡，无疼痛感，无复发史，实验检查USR(+)或RPR(+)，梅毒螺旋体可见。
软下疳为质软的溃疡，局部虽有疼痛感但无复发史，实验检查链杆菌阳性。
其他生殖器部位皮肤病如接触性带状疱疹、白塞病，脓疱病有时与生殖器疱疹相似，可以从病史及检查方面相区别。