早上起床流泪可能是由以下因素导致：
1.在睁眼的时候，角膜上的氧气通过泪液溶解的空气中的氧气来提供，而闭眼的时候氧气则由结膜血管来提供，结膜血管提供的氧气相对少一些，经过一夜的睡眠角膜可能会处于相对缺氧的状态，伴随有一定的干眼症状，这时候会反射性产生更多的泪液以溶解更多的氧气恢复角膜功能。
2.泪腺等器官在睡眠的时候将内部的一些不洁净的分泌物通过泪液等排出。
3.泪腺等器官受到微生物感染，经过一夜的睡眠微生物大量繁殖引起结膜、角膜等炎症反应，从而导致早上起床流泪。