马蹄足和扁平足完全不一样。一般马蹄足会出现足的明显畸形，以及严重的功能障碍。而扁平足很多情况下，并不一定会导致足的功能障碍，也并不一定会出现明显的足的畸形，只有少数患者比较严重的，能够出现相应的足的畸形和功能障碍。
马蹄足主要是涉及到前足的内收内翻畸形，足跟的内翻、踝关节的跖屈，以及胫骨的内旋四种基础的病理改变。而扁平足一般只是产生足弓的低平和塌陷，和遗传、种族，还有生长发育，以及运动功能等方面的因素，都有一定的关系，一般不会出现足的严重的功能障碍。
再有，马蹄足会表现为明显的站立、行走的功能异常，或者出现站立、行走的步态异常。而扁平足的患者，大多数站立、行走是没有任何障碍的，只是在长期站立、行走或者是剧烈运动时，产生局部的疼痛症状。