肛门狭窄一般并不会遗传。肛门狭窄按形成原因可分为先天性肛门狭窄，以及后天性肛门狭窄两种。先天性肛门狭窄属于先天性肛门直肠畸形的一种，是先天发育异常所导致，并非是由于遗传因素所引发。
而后天性肛门狭窄更加和遗传无关，后天性肛门狭窄大多是因为手术不当、局部的炎症，或者恶性肿瘤压迫等原因所导致。
例如患者在行肛门手术时，损伤了过多的肛门周围皮肤，或者术后因为出现感染导致肛门周围皮肤缺损严重，愈合后局部疤痕增生而引发的肛门狭窄。也有可能是肛管癌，或者肛门周围癌的癌肿压迫，所引发的肛门狭窄。