怀孕40天正常情况下做B超能看到孕囊。
如果平时月经规律的女性，月经周期30天左右，当怀孕40天的时候做B超可以看到孕囊，孕囊直径在1cm左右。有的情况下还可以看到卵黄囊。有的人出现胎心早，还会看到胎心胎芽。一般情况下，胎心胎芽是在怀孕6~7周可以看到。
如果女性月经不规律、月经推迟或者是胚胎发育不正常、生化妊娠、宫外孕的情况，在停经40天，应该是宫腔内看不到孕囊。在怀孕期间要正规孕检，预防不良妊娠结局。