直肠息肉的发生，如果是由于溃疡性的直肠炎所引起的伴随性息肉，可以吃药物对症治疗，在临床上比较常用的有5-氨基水杨酸制剂，比如美沙拉嗪肠溶片。也可以使用柳氮磺吡啶片等药物进行对症的治疗。在炎症消退以后，息肉也有自行消除的可能性。
另外，也可以通过直肠给药的方法促进息肉的消退，在临床上可以使用一些中药成分的制剂进行保留灌肠，并且配合清热利湿的药栓肛管直肠内塞入，可以起到良好的治疗效果。
患者在进行药物治疗的同时，也要调整自身的情绪，避免发生情绪上的波动，避免压力过大的情况。注意调整饮食结构，尽量以高热量、高维生素、高蛋白质的食物为主。