急性精囊炎和慢性精囊炎抗生素使用的种类和时间是不相同的。对于急性精囊炎的患者，一般首选广普抗生素控制感染，比如头孢类的药物，必要的时候可以进行细菌培养及药敏实验来指导用药，抗生素的治疗时间一般需连续应用2~3周。
慢性精囊炎的治疗一般相对比较复杂，其抗生素治疗时间也相对较长。抗生素一般选用脂溶性抗生素，比如阿奇霉素、喹诺酮类等药物，治疗时间一般在1~3个月。
对于精囊炎的治疗，除了使用抗生素治疗之外，还需要其他方面的配合，比如尽量避免性方面的刺激，配合温水坐浴和理疗等方法治疗，甚至必要的时候还需要进行手术治疗。