肾结石形成的过程比较复杂，一般正常人尿液中能排出体内能够溶解的代谢的产物，其中有一些难以溶解性的物质。由于各种原因就会造成沉积、潴留在肾内持续生长，并形成肾结石。
促进肾结石形成的因素有尿液中的PH值，如果是酸性尿有利于形成尿酸和胱氨酸结石，如果是碱性尿容易形成磷酸钙结石。另外尿路感染形成的坏死组织、脓液和细菌的聚集，也可以作为结石的核心，逐渐长大最终形成结石。
由于引起肾结石的原因有很多，但不管什么原因引起的肾结石，都有共同的临床表现，比如会出现急性腰痛、血尿、脓尿等。