宝宝细菌感染是否会自愈，这需要根据病情来进行判断。如果感染后出现严重的腹泻，以及伴随有发烧等现象时，就应该及时治疗，避免脱水。如果出现脱水现象就不会自愈，而且还会危及到宝宝生命。
如果细菌感染后只是轻微的腹泻，孩子没有发热以及精神状态好，这种情况下可以不进行治疗。注意饮食卫生，多给宝宝喝点水，这是有利于缓解孩子症状的。
但是如果宝宝腹泻时间比较长，以及食欲不好、经常哭闹等现象时，最好是及时进行粪便培养，确诊是否由细菌感染所导致。