感染尼帕病毒后，在病情早期可能会出现头痛，多与病毒侵犯脑部有关。除此之外，还有可能伴随发热、咽痛、恶心、呕吐等症状，容易与流感病毒感染相混淆。
由于每个患者身体素质不同，感染后的严重程度和临床症状也不尽相同，但对于人体都会造成一定的危害。
尼帕病毒属于新型病毒，最初是在动物体内被发现，后经相关研究表明，尼帕病毒能够引起人畜共患。因此如果处于流行地区，出现不明原因的上述症状，不能忽视尼帕病毒感染的可能性，要尽快采取相关检查、隔离及治疗措施。