是什么引起口腔溃疡，目前尚不明确。口腔局部创伤，像咬伤等可以引起，饮食中维生素或微量元素缺乏也可以引起，个人免疫、精神因素等也可以引起。
口腔溃疡可能是单独性的一种病，也可能是身体其他系统疾病在口腔中的一种表现形式，最常见的口腔溃疡是复发性阿弗他溃疡。
口腔溃疡的诱发因素包括精神紧张、辛辣刺激性食物，或者局部创伤、维生素或微量元素缺乏等都可诱发口腔溃疡，系统性疾病、激素水平改变、遗传或免疫因素，或微生物感染等，都可引起口腔溃疡的发生。