藏毛囊肿不会引起关节疼痛。藏毛囊肿属于皮肤病的一种，好发于臀间裂，其主要症状就是患病部位疼痛，并不会延伸至其他部位，所以不会导致关节疼痛的症状出现。
建议患有藏毛囊肿的患者积极去医院进行治疗，避免病情严重发生感染，引起发热、恶心以及局部疼痛加重的现象，对患者的身体健康造成更大的危害。
临床上对于藏毛囊肿的治疗方法主要是药物治疗，病情比较严重的患者可以采取囊肿切开引流脓液的方法进行治疗，可以达到治愈疾病的目的，手术是最为彻底的。