泌尿系感染发作时需要及时治疗。首先需应用抗生素抗感染治疗，一般首选广谱抗生素。可在应用抗生素治疗之前，先留取尿细菌培养并做药物敏感实验，根据相应的结果来指导抗生素应用。
泌尿系感染会出现排尿异常的症状。所以除了应用抗生素治疗之外，还可应用一些改善排尿的症状的药物，比如α受体阻滞剂坦索罗辛等。此外如果出现发热等症状时，可以应用解热镇痛药物对症治疗。
中医中药对于泌尿系统感染也有比较好的疗效，在药物治疗的同时也需多喝水，注意保持个人卫生，饮食清淡，多吃新鲜的蔬菜和水果，禁食一些辛辣刺激性的食物。