肝癌晚期会出现疼痛的症状，这种疼痛可以发生在多个部位，例如腹部疼痛、头痛、胸痛以及骨痛。不同部位的疼痛，造成疼痛的原因也各不相同。
肝癌的腹痛多是由于肝癌晚期的肿瘤较大，造成了肝脏体积增大，肝被膜受到牵拉从而引起腹部胀痛。还有的晚期患者发生了腹腔内脏器的转移，侵犯到神经或压迫神经也造成腹痛。
晚期肝癌颅脑转移后，由于颅内压增高，引起头痛的症状。晚期肝癌胸部疼痛是由于肺组织的损害，或者胸部神经的病变侵犯导致。