流感引起的心肌炎，属于病毒性心肌炎。病毒性心肌炎大多数病程有自限性，经过治疗可以完全治愈。
但是如果病毒性心肌炎，呈暴发性心肌炎或者重症心肌炎发作，这时候患者的病情将会非常严重，死亡率高，预后差。有一些病毒性心肌炎可以转为慢性，一旦转为慢性，病毒性心肌炎将会持续存在，不能治愈，随着病情的发展逐渐变成扩张型心肌病，出现心脏扩大、心肌收缩力下降，以及发生各种类型的心律失常，甚至引起患者猝死，有时候还会引起血栓栓塞事件的发生。
总的说来，流感引起的心肌炎，大多数的患者可以治愈，只有少部分的患者，会出现死亡或者转为慢性。