长期服用云南便秘果有副作用，副作用有以下几个方面：
首先是可能会产生依赖性，出现不吃便秘果就不排便的情况。其次，长期服用云南便秘果，可能会导致腹泻，损伤肠道的黏膜。此外服用云南便秘果后主要经过肝肾代谢，长期大量服用云南便秘果会加重肝肾的负担，有可能造成肝肾损伤，出现转氨酶和肌酐的升高。最后，长期服用云南便秘果后胃肠道蠕动比较快，食物中的一些营养成分不能吸收完全，还可能会出现营养不良的情况。
因此，便秘的患者可以偶尔服用云南便秘果，但不要长期大量服用。如果想根治便秘，应该查明便秘的原因，然后对因治疗。