抵抗力下降是引发肛瘘的重要原因之一。
肛瘘是由于肛腺感染化脓后，感染扩散至肛门周围软组织，形成肛周脓肿。肛周脓肿经切开引流术或自行破溃后流出脓液，转为慢性炎症感染，逐渐形成肛瘘。当进食辛辣等刺激性食物后，肛腺分泌量增加，容易引起堵塞，形成化脓性感染。
肛腺感染的另一个原因是，因为身体抵抗力下降或者肛门卫生差，细菌在肛门口大量滋生，而引起感染。因此当抵抗力下降时，机体对于细菌的防御能力减弱，会诱发肛门软组织感染，引起肛瘘。