针灸的疗程是由患者的体质、疾病本身的情况，以及针灸医师所采取的针法来决定的。不同疾病类型的患者因体质不同，针灸师采取的针法不同，所以一般疗程也不相同。
一般急症的疗程相对比较短，如腰部扭伤、颈部扭伤、跌仆损伤、内脏疼痛等，一般三到五天疼痛缓解后，疗程就可结束。虚证的疗程一般比较长，而且很多情况下虚证需要治疗不止一个疗程。一般是以十天为一疗程，中间间隔三到五天后进行第二疗程。
一些年老体弱的患者，因病程时间非常长，所以一般需要3到5个疗程之后才能略有成效。