马尔尼菲青霉菌病，是通过临床症状和相关的检查来发现的。
这种疾病的主要症状，会引起人体出现发热，可以出现高热的现象，体温能够达到40℃以上。而且会引发咳嗽、咳痰、胸闷等诸多症状，还有可能会引发乏力、消瘦等改变，会在皮肤表面形成一些典型的丘疹、结节，能在这些丘疹中间见到一些轻度的凹陷现象，对人体的皮肤会产生明显的影响。
出现这些可疑症状之后，则需要做相关的检查，建议做真菌培养。如果能够培养出这种青霉菌，基本就可以确诊。也可以选择做皮肤病理学检查，判断是否有真菌的存在，也具有诊断意义。