引起肛门有分泌物的原因有很多，需要根据病因选择治疗方法。
如果是痔疮肿物脱出肛门无法回纳时，可引起肠道的分泌物流出来。可以用清热解毒的中药熏洗坐浴，配合用痔疮栓，痔疮膏治疗，促进痔疮的逐渐缩小，回纳进肛门。如果比较严重的痔疮也可以进行手术治疗。
如果是肛裂引起的分泌物，可用高锰酸钾坐浴，再用去腐生肌的药膏涂抹在裂口患处，促进伤口愈合，可解决肛门有分泌物的问题。
如果是肛瘘引起的，需要做手术治疗。低位肛瘘可采取肛瘘切除术，高位肛瘘可以采取挂线术治疗，伤口愈合后，肛门就不会有分泌物了。