内膜异位症是导致不孕症的常见的原因。
对于子宫内膜异位症导致不孕，药物治疗对于改善生育状况的帮助并不是很大。腹腔镜手可以提高术后的妊娠率，治疗效果取决于病变的严重程度。对于希望妊娠的病人，术后不应应用药物巩固治疗，而应该进行促排卵的治疗，应该争取尽早妊娠，在手术后两年内，如果不能妊娠的情况下再次妊娠的机会是比较少的。
除根治性手术以外，异位症的复发率比较高，复发率与病情的轻重、治疗的方法、随访时间的长短以及统计方法有关。重症病人的复发率高于轻症的病人，病情越重复发越快，因此对于子宫内膜异位症的病人在手术治疗或者药物治疗以后要尽快的让病人争取怀孕，因为子宫内膜异位症会反复发作，再次不孕的风险比较高。