新冠病毒在入侵肺部之后，率先进入肺泡，主要是藏匿在肺泡里，长期下去会引起深部气道和肺泡炎症，然后通过炎症反应来攻击肺组织，所以在X光下看患者的肺部会呈现大片白色，俗称白肺。
但是新冠病毒并不是仅仅在肺部藏匿，在心脏、食道、肾等器官中都发现过与肺泡里相似的病毒基因，所以这些器官都有可能会被新冠病毒入侵，从而损坏器官造成多器官功能衰竭。
目前并未发现新冠病毒在血液内传播，所以其它器官受损还有可能是肺部功能障碍导致的。