新冠疫苗不打第二针是会影响疫苗效果的，甚至起不到应有的保护作用。
目前推出的新冠灭活疫苗需要接种两针，从临床数据分析，仅接种一针效果是不好的，只有两针接种，才能起到有效的保护作用。一般新冠疫苗的保护作用至少可以维持半年，此后是否可能有所减弱甚至消失，还有待于进一步观察。
另外也需要指出，目前我国也推出了腺病毒载体新冠疫苗，这种新冠疫苗相对于新冠灭活疫苗等疫苗，使用较为方便，仅需要接种一针，就可以起到有效的保护作用。